Program Cek Kesehatan Gratis di sekolah di Indonesia menargetkan untuk mencapai 53 juta siswa di seluruh negeri. Mulai dari sekolah negeri, swasta, hingga sekolah berbasis keagamaan, semua siswa di Indonesia akan mendapatkan layanan CKG. Presiden Prabowo Subianto berkomitmen untuk menjadikan sumber daya manusia Indonesia sebagai generasi emas pada tahun 2045. Berbagai kebijakan strategis telah diterapkan, termasuk program Makan Bergizi Gratis, Peningkatan kapasitas RSUD, dan lainnya dalam rangka memastikan masa depan anak-anak Indonesia yang terjamin. Pelaksanaan CKG juga melibatkan lembaga pendidikan agama dan keagamaan, seperti madrasah, pesantren, dan sekolah Kristen, Katolik, Hindu, dan Buddha guna mendukung visi Indonesia Emas 2045. Kementerian Agama juga telah meminta seluruh lembaga pendidikan untuk mendukung program ini dengan menyediakan fasilitas dan melibatkan guru serta tenaga kependidikan dalam pendampingan teknis. Seluruh Kepala Kanwil dan Kepala Kankemenag diminta untuk mengawal program CKG di sekolah, dengan ancaman perlakuan khusus bagi sekolah yang tidak memberikan perhatian penuh.
